寵物管理科於2021年9月初時由陳吉仲宣布即將成立，除了將其同樣規劃為農委會畜牧處下轄單位、與動物保護科為同層級外，也將原先屬動物保護科管理的「寵物戶口、繁殖、買賣、寄養、食品、生命紀念、展演動物」等業務，轉由寵物管理科負責，目標是負起毛小孩「從出生到死亡所有階段全面照顧」的使命。
而在歷經一段時間的學者專家、公民團體、產業團體等各界座談與討論，陳吉仲3月16日在出席台灣寵物趨勢論壇表示，已凝聚多項共識，包含制定「寵物產業管理」專法，逐步建構「寵物分級管理」、「源頭流向履歷」、「寵物新興市場發展」、「完善動福評估並推展動福教育」等4大策略。
4月3日陳吉仲出席成立典禮再次強調，我國700萬家戶中，飼養寵物的已超過250萬隻，且每年以10％速度成長；推估到2040年，全台將有1200萬隻毛小孩。而應寵物而生的各項產業也蓬勃發展，產值超過500、600億元。因此寵物管理科的成立，除相關經費估計達1.3億全部到位外，在中央將有至少將有6名的專任人力，各地方政府則共有至少95名，政策目標是要讓寵物一生的食、衣、住、行、育、樂，都有完整的配套。
行政院農業委員會也再發布貼文說明4大策略細節：
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建構寵物分類分級管理制度：鑑於目前寵物種類多樣，將會清查市場流通物種，並依照動物福利、人畜安全及入侵風險3大指標，建立多元物種風險評估、分類與分級機制。未來將不適合飼養的物種提為黑名單，限制飼養與輸入；將適合家庭飼養的物種提為白名單，發展出相關的動物福利指引，希望能使飼主責任落實。並且，將全面建構行政能量可負擔的寵物管理制度，包含研擬多元寵物販售市場分類分級管理措施。
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建構寵物「源頭及流向履歷」資訊化管理制度：總統蔡英文特別表示，政府將進一步修正《動物保護法》，更落實寵物出生登記，且在每一次轉讓都要辦理變更登記，亦即從出生到死亡都會有記錄，確保「源頭流向履歷制度」。同時，也要將寵物繁殖、買賣紀錄及買賣歷程取代傳統紙本的人力管理，朝向資訊化管理。
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建構寵物多元業態管理機制：從寵物的食、衣、住、行、育、樂方面，著手研擬相關產業管理的專法、新興商業行為的管理手段，以及消費糾紛的解決模式。
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完善動物福利評估基準與動物福利教育：推動各類寵物及展演動物飼養照護指引，並在12年國教當中加入與提升國民動保知識。
而目前雖主要納管的寵物為犬貓，但農委會也表示，未來將持續增加其他物種。總統蔡英文也指出，「寵物管理科」的成立只是一個開始，接下來政府會持續檢討精進，希望逐步建構兼顧動物福利跟消費者的權益的管理制度。
陳吉仲也強調，此次寵物管理科的成立，為各項寵物政策奠定了重要的基礎，而將來若農業部成立後會有動保司，甚至可能像內政部一樣，有各種專責部門，例如寵物食品、保健食品、寵物保險等，也皆應有專責單位，他強調：「人有的，毛小孩也應該要有」。
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